หนึ่งปีผ่านไปนับตั้งแต่ Black Rebellion การลุกฮือล้มเหลวกับจักรวรรดิ Holy Britannian ที่นำโดยศาล Zero สวมหน้ากาก Zero ซึ่งปัจจุบันหายไป ที่สูญเสียโดยไม่ต้องผู้นำการปฏิวัติของพวกเขากลุ่มต่อต้าน 11 พื้นที่ Black Knights - พบว่าตัวเองไม่มีอำนาจมากเกินไปที่จะต่อสู้กับความโหดร้ายที่ก่อให้เกิดกับ Elevens โดย Britannia ซึ่งได้เพิ่มขึ้นอย่างมีนัยสำคัญเพื่อที่จะบดขยี้ความหวังของการก่อจลาจลในอนาคตใด ๆ Lelouch Lamperouge สูญเสียความทรงจำทั้งหมดในชีวิตคู่ของเขาและอาศัยอยู่อย่างสันติพร้อมกับเพื่อนของเขาในฐานะนักเรียนชั้นมัธยมศึกษาที่ Ashford Academy อดีตคู่หูของเขา C.C. ไม่สามารถยอมรับเหตุการณ์นี้ได้ทำให้ตัวเขาเองต้องเตือนให้เขาทราบถึงจุดมุ่งหมายในอดีตของเขาหวังว่าศูนย์บงกช Zero จะลุกขึ้นอีกครั้งเพื่อเสร็จสิ้นสิ่งที่เขาเริ่มต้นในบทสรุปอันน่าตื่นเต้นนี้ให้กับซีรีส์