ซีรี่ส์ตามด้วยการผจญภัยของเบ็น เท็นนีสัน ผู้ครอบครองออมนิทริกซ์ อุปกรณ์ที่เหมือนกับนาฦกาข้อมือที่ทำให้เบ็นแปลงร่างเป็นเอเลี่ยนได้ เรื่องราวได้เปลี่ยนแปลงสลับไปมาระหว่างช่วงที่เบ็นอายุ 11 ขวบ (หนึ่งปีหลังจากซีรี่ส์ดั้งเดิม) และเบ็นตอนอายุ 16 ปี (สองสามเดือนหลังจากเบ็นเท็น อัลติเมท เอเลี่ยน) หลังจากเกว็นออกไปเข้าเรียนมหาวิทยาลัย และเควินก็ออกไปอยู่ใกล้ๆ เธอ เบ็นตอนอายุ 16 ปีได้มีคู่หูใหม่ ชื่อ รู้ก ช่างประปาต่างดาว ชื่อเต็มว่า รู้ก บลอนโก้ (นามสกุลตัวแรก) ในภารกิจสำรวจความลับของเมืองเอเลี่ยนใต้ดินลับๆ แห่งหนึ่ง ชื่อ อันเดอร์ทาวน์ เบ็นสำรวจด้านหนึ่งที่แปลกของบางสิ่งในเมืองใต้ดินของเอเลี่ยน และค้นพบว่า ศัตรูเหล่านั้นจากอดีตของเขากำลังรวมกลุ่มกัน หลังจากนั้น เบ็นได้เป็นเป้าหมายโดยนักล่าปริศนาที่รู้จักในชื่อ ไคห์เบอร์ ผู้ที่ทำงานให้กับมัลแวร์ (เมคามอร์ฟสายพันกัลวานิคโรคจิต) และด๊อกเตอร์ ไซโคบอส (นักวิทยาศาสตร์สติเฟื่อง เผ่าเซเรโบรครัสเตเชี่ยน) ใน ”ที จี ไอ เอส” มันถูกเปิดเผยว่า เบ็นเท็น ออมนิเวอส ได้แบ่งปันเรื่องราวกับการ์ตูนเรื่อง The Secret Saturdays